社保稽查科是由人力资源和社会保障部门负责管理的。人力资源和社会保障部门是国家机构，主要负责制定和实施劳动力和社会保障政策，保障劳动者的权益，维护社会稳定。
社保稽查科作为其中的一个重要部门，负责监督和管理社会保障制度的实施，对企业和个人的社会保险缴费情况进行调查和稽查，保障社会保障制度的公平、公正和合法性。因此，社保稽查科是由人力资源和社会保障部门管辖的。
社保稽查是社保部门为了防上有些企业少缴，虚报社保基数等开展的核查事项，以保障劳动者的权力，切实保护基金的增值安全而展开的专项活动。
社保稽查有专门的科室来从事这项工作，定期不定期的对企业社保申报核定进行核查，并对虚报的社保基金进行追缴。