根据马自达6的官方硬件手册和维修指南，飞轮垫片应该被安装在自动变速器和发动机之间。换句话说，它应该被安装在内部。飞轮垫片起到隔离和补偿发动机转动和变速器内部机械传动的作用，因此其正确的位置和功能是非常重要的。

如果飞轮垫片被误安装在外部，则会导致机械传动的摩擦，并最终导致机械故障和损坏。

因此，更加建议的做法是，让熟练的机械师在更换飞轮垫片时仔细检查其安装位置，确保其正确安装在内部。