在厦门，职工社保的缴费基数和档次是根据个人上年工资的60%～300%来确定的。具体来说，社保的缴费基数一般有最低档40%、一档60%、二档80%、三档100%、最高为300%等。因此，厦门职工社保3300基数可能是指二档或三档。
厦门市城镇职工基本医疗保险规定的退休时累计缴纳基本医疗保险费的年限为男满25年，女满20年。
需要注意的是，这是办理医疗保险在职转退休的最低缴费年限，而办理养老保险退休的最低缴费年限是15年。
根据基础思想，社保缴费年限对退休年限是有影响的。因此，厦门职工社保中间交了几个月灵活社保会影响退休年限。
具体来说，社保缴费年限会影响退休金数额，缴费年限越长，退休金数额越高，而中间交了几个月灵活社保会影响缴费年限，从而影响退休金数额。因此，如果中间交了几个月灵活社保，将影响退休年限和退休金数额。
综上所述，社保缴费年限对退休年限是有影响的，中间交了几个月灵活社保会影响退休年限和退休金数额。