一般来说，蘑菇的生产是不能使用农药的，但是一些特殊情况下，例如双孢菇，采收后可能会有人使用焦亚硫酸钠处理，这样就会有硫的残留。对于市场上颜色特别白的蘑菇，不建议购买。
香菇是一种低级生物，生长速度快，代谢能力低，不能代谢部分农药，所以在食用前需要充分清洗。
然而，现在的多数农药是高效低残留的，半衰期很短，所以也不必过度担忧农药残留。人工种植的香菇需要人工干预，如施肥施药，但是菌孢和没放进大棚以前只是喷撒在土上极淡一点，而菌孢接触地面只是小拳头大小一点点，所以不必担心农残。
总的来说，菇类的农药重金属残留情况因养殖方式和环境而异，消费者在购买和食用时需要注意。
蘑菇是膳食纤维。
高纤维食物有粗粮、蔬菜、水果、菌类等。
高纤维食物是指含膳食纤维较多的食物，具有增强肠道蠕动、促进排便等作用。
下列食物中富含膳食纤维：
粗粮类：如小米、玉米、高粱、燕麦、荞麦等；
水果类：多种鲜果及干果；
菌藻类：如紫菜、蘑菇、木耳、海带等；
其他：如各种干豆类、魔芋、果胶等。
蘑菇有农残
农药残留（Pesticide residues），是农药使用后一个时期内没有被分解而残留于生物体、收获物、土壤、水体、大气中的微量农药原体、有毒代谢物、降解物和杂质的总称。施用于作物上的农药，其中一部分附着于作物上，一部分散落在土壤、大气和水等环境中，环境残存的农药中的一部分又会被植物吸收。残留农药直接通过植物果实或水、大气到达人、畜体内，或通过环境、食物链最终传递给人、畜。