用工具清理
鱼缸底部出现鱼粪便和一些脏东西的时候，可以利用工具来清理，最常见的工具就是软管。把软管伸入鱼缸的底部，利用虹吸原理，把鱼缸底部的鱼粪便和水一起吸出来，随后再向鱼缸中补充适量的新水，这样就能把鱼缸中的鱼粪便清理干净。在鱼缸中安装过滤器，也能帮助人们清理鱼缸底部出现了鱼粪便防止水变质
1、生物清理
鱼缸鱼屎太多，可采取生物清理。可在缸内养殖黑壳虾、清道夫或螺类，这些生物能将缸内的鱼屎清理干净。但需注意的是，黑壳虾往往会成为一些鱼类的食物，在混养时需规避风险。并且螺类建议选择汽水螺，避免在缸内大量繁殖。
2、换水清理
日常在给鱼缸换水的同时，也可清理掉缸底的粪便。由于在换水时，需先抽出水分，抽水可直接从鱼缸底部开始，只要没有铺设底砂，就可将缸底的鱼屎都抽干净，能起到较好的清洁效果，之后可沿着鱼缸壁缓慢的倒入清水。
3、过滤清理
还可采用过滤的方法来清理缸底的鱼屎，可在缸内假装过滤系统，水流能将鱼屎带入过滤盒中，就能清理掉鱼屎，之后鱼屎会被分解，产生的氨氮会被硝化菌所转化，从而保证了水体的干净卫生。
1. 砂石底：使用细沙、砂砾或玉石等材料铺设底部，可以模拟鱼类天然栖息环境，让鱼缸看起来更加自然。需要注意的是，砂石要事先清洗，以去除杂质和有害物质。
2. 水草底：选择适合水草生长的底材，如水草泥或氮石等，再通过种植水草来增添鱼缸的观赏价值。水草的生长需要光照和适当的养分，所以在铺设水草底之前需要准备好相应的照明和肥料。
3. 石块底：可以使用小型石块或鹅卵石铺底，这种材料常常用来模拟自然水下的石头堆砌。注意石块要平整、不锋利，以免伤害鱼类。
4. 仿真景观底：使用人工仿真景观材料，如岩石板、模拟水生植物、塑料地毯等，可以给鱼缸营造出独特的观赏效果。这些材料易于清洁，但要注意选择无害的材料。