偃师二高撤校的主要原因是：一是缺乏经济条件。按照国家规定，中学应当有适当的学校场地、教学设施、资金等，但偃师二高缺乏这些经济条件，使得学校无法正常运行。二是学生人数太少。由于学生人数过少，学校的教学质量无法得到保证，学生的学习水平也无法得到提高，且学校的经费支出也无法保障。三是偃师二高实行小学到初中三年制课程，无法满足学生学习需要。与其他学校相比，偃师二高的教学质量落后，无法为学生提供良好的学习环境。因此，偃师二高最终决定撤校，以满足学生的教育需求，确保学生的学习质量和学习成果。