港澳通行证预留指纹是右手食指。自2018年4月1日起，中国公民申请港澳通行证时需要进行指纹预留。通行证指纹采集由公安机关负责，采用的是无接触非接触式指纹采集，包括指纹图像和指纹特征。指纹采集时需要进行四个手指的采集，分别为右手食指、左手食指、右手中指、左手中指。其中，右手食指是用于通行证指纹比对和验证的主要参考手指。通行证指纹预留的目的是为了提高边境安全，便于海关、边防和公安机关开展有效管理和服务。
内地公民因私事前往香港、澳门，凭公安机关签发的前往港澳通行证或者往来港澳通行证，从指定的口岸通行；返回内地也可以从其他对外开放的口岸通行。内地居民可单独申请往来港澳通行证。
办理所需证件以及材料填写范本：
1、《中国公民出入境证件申请表》(须按要求填写完整)。
2、本人近期照片(尺寸48X33mm,正面,免冠,白底,彩照,白发或无发者为淡蓝色底)。
3、本人居民身份证或居民临时身份证(原件及复印件,未满16周岁无须提供)。
4、已持有效《往来台湾通行证》的，提交《往来台湾通行证》。
（1）第一次使用卡式通行证必须走人工通道，第二次开始则可以走自助通关
（2）自助通关的机子一共有两关
第一关：按照机子上的图标，把卡放在验证机上，上面会有中文提示，可以取卡后将卡移走，门自动打开
第二关：验证指纹，镜头识别面部，把拇指放上去验证即可