有8个门。
1号门位于植物园路，进门右边就是石象路。
2号门和3号门位于梅花谷附近，从3号门前往“长生鹿苑”比较便捷，还能看到燕雀湖和水杉美景。
4号门紧靠中山陵园管理局。
6号门位于红楼艺文苑处，为了纪念《红楼梦》与古金陵的历史因缘而建。
7号门通往紫霞湖，途中经过颜真卿碑林、刘勰与文心雕龙纪念馆。
8号门走的人比较少，大概位于从紫霞湖东侧往六朝建筑遗址的通道附近。
可以从明孝陵3号门进入景区，3号门靠近地铁2号线苜蓿园站1号口，推荐游览路线如下：明孝陵3号门——燕雀湖——长生鹿苑——梅花谷/梅花山——东吴大帝孙权纪念馆——明孝陵神道&石象路——红楼艺文苑——文武方门——明孝陵——明东陵——颜真卿碑林——紫霞湖