根据不同城市和地区、公证机构的不同，兄弟分房产协议公证的费用也会有所不同。一般来说，公证费用包括证书费、鉴证费、服务费等，总体费用相对较低，一般在几百元至数千元之间。但具体费用还需根据当地公证机构的收费标准而定，建议事先咨询机构或公证员了解相关费用及公证流程等信息。
如果兄弟要进行分户口，需要准备以下证件和材料：
1.户口本或者身份证原件及复印件；
2.房产证或者租房合同、水、电、燃气缴费单；
3.结婚证或者单身证明；
4.近期的照片（两寸或者一寸两张）；
5.户口迁移证明或者派出所开的流动人口证明；
6.其他材料（比如公证、委托书等）。建议提前确定好相关流程和要求，避免遗漏重要资料，造成办理时间的延长。不同地区可能会略有不同，请以当地实际规定为准。